紅十字會於0206南台地震專案中，編列包括：「罹難者家屬慰問」每一罹難者新台幣(下同)十萬元；「傷者慰問」依重傷、中輕傷及曾就醫已離院分別補助十萬元、三萬元及五千元; 「傷者照護補助」重傷者連續六個月、中輕傷者兩個月，每月各兩萬元。「截肢重建補助」包括義肢、輔具、復健及交通費等。另「教育補助」國中小、高中及大學生各一萬、四萬、五萬元。因房屋毀損需「家用品補助」者每戶五萬元，紅十字會與遠東集團合作提供提貨劵購置，台灣飛利浦公司並捐贈電子鍋及照明設備。「生活急難補助」一次性補助三萬元，但生活貧困者可連續六個月、每月補助兩萬元。

        目前第一波慰問金已於3月26日發放完成，包括：罹難者家屬慰問、傷者慰問、傷者照護、截肢重建、急難生活補助金、遷居補助及家用品補助等，共97案188人受益，當天發放總金額新台幣1,908萬元。針對南台地震的教育補助項目，亦已核定34人，其中幼兒園及國中小17校26人、高中2校2人、大學3校6人，為加速進行，本會採行與校方合作陸續核銷撥款中，金額共計64萬元。至於受地震影響的學校修繕部份，本會已委請營建研究院一一進行專業複勘，作業完成後會儘速與學校達成共識，發包修繕並負責監督管理工程進行。

考量民眾申請時間，紅十字會總會將各項補助慰問金申請期限延長至4月15日，也提醒有需要的民眾提出申請。